Для проверки нагрузки на диск в Linux можно пользоваться двумя утилитами: iotop и iostat.
Утилита iotop показывает создаваемую нагрузку по процессам, показывает "мгновенный" ввод-вывод всех процессов по отдельности и всей дисковой подсистемы (сверху).
Утилита iostat показывает обращения к диску, ее можно использовать, например, так:
iostat -x -m 3