Чтобы шла загрузка из XML и загружаемые данные добавлялись как новые, нужно указать пустую ссылку (в виде нулей) и пустой код (в виде пустой строки).

<Ref>00000000-0000-0000-0000-000000000000</Ref>

и

<Code></Code>

Пример:

<root>

<CatalogObject.КодыСистем>

<Ref>00000000-0000-0000-0000-000000000000</Ref>

<IsFolder>true</IsFolder>

<DeletionMark>false</DeletionMark>

<Parent>00000000-0000-0000-0000-000000000000</Parent>

<Code></Code>

<Description>Набор какихто кодов</Description>

<НаименованиеСистемы/>

</CatalogObject.КодыСистем>

<CatalogObject.КодыСистем>

<Ref>00000000-0000-0000-0000-000000000000</Ref>

<IsFolder>false</IsFolder>

<DeletionMark>false</DeletionMark>

<Parent>00000000-0000-0000-0000-000000000000</Parent>

<Code></Code>

<Description>Какой-то код</Description>

<НаименованиеСистемы/>

</CatalogObject.КодыСистем>

</root>