В современных дистрибутивах, для лучшей работы со звуком можно сделать следующие настройки.
Нужно в /etc/security/limits.conf перед концом файла добавить:
@audio - rtprio 90
@audio - nice -19
@audio - memlock unlimited
что даст повышенный приоритет обработке аудио-устройств.
Если этих настроек недостаточно, нужно ставить RT (real time) ядро.