Добиться русской раскладки клавиатуры в LXDE графическими средствами у меня не получилось, поэтому запускаем:

setxkbmap -option grp:switch,grp:alt_shift_toggle us,ru

После этого клавиатура переключается по Alt+Shift (это поведение можно менять, меняя alt_shift_toggle на то, что вам нравится) между русской и английской (естественно, вместо us,ru можно написать те варианты, которые вам нужны).

Эту команду надо запускать не от рута, а от пользователя, под которым произошел логин.

Чтобы запускать эту команду каждый раз при запуске LXDE, нужно добавить в конец файла ~/.config/lxsession/LXDE/autostart (если его нет или даже нет каталога, то нужно создать) или глобального файла /etc/xdg/lxsession/LXDE/autostart строчку:

@setxkbmap -option grp:switch,grp:alt_shift_toggle,grp_led:scroll us,ru >> /etc/xdg/lxsession/LXDE/autostart

или:

echo "@setxkbmap -option grp:switch,grp:alt_shift_toggle us,ru" >> /etc/xdg/lxsession/LXDE/autostart

Комментарий: На самом деле апплет для настройки раскладок клавиатуры в LXDE есть! Но в Debian 7.8 настроечных оций в нем почти нет, и настроить раскладку в нем невозможно. А в Debian 7.10 уже другой апплет и в нем раскладка настраивается