1.

Под файлопомойку я бы ставил RAID5 (несколько помедленнее RAID10, зато жесткие диски используются более эффективно, а бэкапы, обычно, ночью делаются, так что скорость работы дисков тут не сильно и важна, важнее чтобы места под них хватало). Контроллер лучше внешний + 2-й такой же про запас на случай выхода из строя контроллера (такое тоже случается, а RAID-массив на "чужом" контроллере, обычно, не видится). Кстати, процессор на файловом хранилище, сильно не задействуется, так что его и 2-м контроллером домена можно сделать.

2.

Какого нибудь Intel Xeon E5606 / 16Gb RAM / 2x500G + 1Tb backup/ DVD±RW / 6U / 600W это адекватное предложение или можно дешевле?