Чтобы запустить графическое приложение из-под пользователя root в Wayland, нужно установить специальное значение для переменной XDG_RUNTIME_DIR.

А именно, в переменной XDG_RUNTIME_DIR нужно указать директорию процессов текущего обычного пользователя, под которым происходил логин в графическую систему (а не пользователя root). Делается это следующим образом:

[root@wbx-desktop whbex]# export XDG_RUNTIME_DIR=/run/user/1001

[root@wbx-desktop whbex]# gparted

GParted 1.5.0

configuration --enable-libparted-dmraid --enable-online-resize

libparted 3.6

Здесь предполагается, что у залогиненного пользователя идентификатор 1001. Узнать идентификатор текущего пользователя можно через команду id:

$ id

uid=1001(vasya) gid=1001(vasya) группы=1001(vasya),44(video),132(wireshark)