Как удалить подключенную базу с зашифрованными элементами, от которой мне никакого прока?

Удалить ее каталог, а MyTetra перенастроить на другой каталог. Каталог прописан в файле conf.ini, данный файл может лежать либо в директории с бинарником, если MyTetra ставилась в режиме портабельного приложения, либо в каталоге пользователя, подкаталог ./config/mytetra.