В простом случае (когда не требуется сборка нативных библиотек) можно обойтись следующим скриптом:
mkdir output
pipenv lock -r > requirements.txt
pip install -r requirements.txt --no-deps -t output
zip -r output.zip output
В более сложном случае (когда из-за нативных библиотек нужно в процессе сборки использовать наиболее похожее к AWS Lambda окружение) можно использовать для сборки Docker:
mkdir output
pipenv lock -r > requirements.txt
docker run --rm \
-v $(PWD)/output:/var/task:z \
-v $(PWD)/requirements.txt:/requirements.txt:z \
-u 0 lambci/lambda:build-python3.8 \
python3.8 -m pip install -t /var/task/ -r /requirements.txt
zip -r output.zip output