В версиях новее SQLite 3.25.0 поддерживаются оконные функции, и нумерацию строк можно сделать следующим образом:

SELECT

*,

ROW_NUMBER() OVER(ORDER BY Id) AS NoId

FROM data

Для более старых версий приходится пользоваться хаками:

SELECT

id,

value,

(SELECT count(*) FROM tbl b WHERE a.id >= b.id) AS cnt

FROM tbl a